Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TM9SF4Q92544 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TM9SF4Q92544 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TM9SF4Q92544 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TM9SF4Q92544 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TM9SF4Q92544 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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TM9SF4Q92544 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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TM9SF4Q92544 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM9SF4Q92544 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM9SF4Q92544 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM9SF4Q92544 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM9SF4Q92544 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM9SF4Q92544 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM9SF4Q92544 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM9SF4Q92544 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM9SF4Q92544 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM9SF4Q92544 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TM9SF4Q92544 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TM9SF4Q92544 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TM9SF4Q92544 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM9SF4Q92544 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM9SF4Q92544 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM9SF4Q92544 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM9SF4Q92544 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM9SF4Q92544 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM9SF4Q92544 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM9SF4Q92544 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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