Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CTTNBP2Q8WZ74 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CTTNBP2Q8WZ74 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CTTNBP2Q8WZ74 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms