Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNAAF4Q8WXU2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNAAF4Q8WXU2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNAAF4Q8WXU2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNAAF4Q8WXU2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNAAF4Q8WXU2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNAAF4Q8WXU2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNAAF4Q8WXU2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNAAF4Q8WXU2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNAAF4Q8WXU2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNAAF4Q8WXU2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DNAAF4Q8WXU2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms