Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC12Q8WVT3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC12Q8WVT3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms