Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TRIM41Q8WV44 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TRIM41Q8WV44 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC40.1■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
TRIM41Q8WV44 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC40.06■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC40.06■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms