Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSKUQ8WUA8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSKUQ8WUA8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms