Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER0

SNED1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1Q8TER0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SNED1Q8TER0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SNED1Q8TER0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNED1Q8TER0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNED1Q8TER0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms