Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX29Q8TEQ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX29Q8TEQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX29Q8TEQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX29Q8TEQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX29Q8TEQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX29Q8TEQ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX29Q8TEQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX29Q8TEQ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms