Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF3IP1Q8TDR0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms