Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRSK1Q8TDC3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms