Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF398Q8TD17 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms