Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC110Q8TBZ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms