Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PJA1Q8NG27 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PJA1Q8NG27 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms