Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID1BQ8NFD5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID1BQ8NFD5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms