Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVR1CQ8NER5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1CQ8NER5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVR1CQ8NER5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVR1CQ8NER5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms