Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C17orf47Q8NEP4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms