Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARRDC4Q8NCT1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARRDC4Q8NCT1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
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