Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KBTBD3Q8NAB2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KBTBD3Q8NAB2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms