Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMNTD1Q8N9Z9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMNTD1Q8N9Z9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms