Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC89Q8N998 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC89Q8N998 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms