Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR7Q8N806 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR7Q8N806 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR7Q8N806 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR7Q8N806 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBR7Q8N806 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR7Q8N806 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms