Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO5AQ8N6Q1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms