Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSGALNACT2Q8N6G5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms