Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MINDY1Q8N5J2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MINDY1Q8N5J2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MINDY1Q8N5J2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MINDY1Q8N5J2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MINDY1Q8N5J2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MINDY1Q8N5J2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MINDY1Q8N5J2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MINDY1Q8N5J2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MINDY1Q8N5J2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MINDY1Q8N5J2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MINDY1Q8N5J2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms