Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFRP1Q8N474 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFRP1Q8N474 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms