Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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LINC00269Q8N2A0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00269Q8N2A0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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LINC00269Q8N2A0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LINC00269Q8N2A0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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