Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NELFCDQ8IXH7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NELFCDQ8IXH7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NELFCDQ8IXH7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NELFCDQ8IXH7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NELFCDQ8IXH7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NELFCDQ8IXH7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NELFCDQ8IXH7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NELFCDQ8IXH7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NELFCDQ8IXH7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NELFCDQ8IXH7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NELFCDQ8IXH7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NELFCDQ8IXH7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms