Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL3Q8IVW4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL3Q8IVW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL3Q8IVW4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL3Q8IVW4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL3Q8IVW4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL3Q8IVW4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL3Q8IVW4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL3Q8IVW4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDKL3Q8IVW4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKL3Q8IVW4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms