Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FUNDC1Q8IVP5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FUNDC1Q8IVP5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FUNDC1Q8IVP5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FUNDC1Q8IVP5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FUNDC1Q8IVP5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FUNDC1Q8IVP5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FUNDC1Q8IVP5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FUNDC1Q8IVP5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FUNDC1Q8IVP5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FUNDC1Q8IVP5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FUNDC1Q8IVP5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FUNDC1Q8IVP5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms