Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS6Q8IU80 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms