Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB43Q86YS6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB43Q86YS6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB43Q86YS6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB43Q86YS6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB43Q86YS6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB43Q86YS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB43Q86YS6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms