Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5Q86VQ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms