Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC84Q86UT8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC84Q86UT8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms