Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD3Q86TU7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SETD3Q86TU7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD3Q86TU7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms