Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLNKQ7Z7G1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLNKQ7Z7G1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms