Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM46Q7Z4K8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms