Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LYSMD3Q7Z3D4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LYSMD3Q7Z3D4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD3Q7Z3D4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms