Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP9Q7RTR0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms