Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
KNDC1Q76NI1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
KNDC1Q76NI1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
KNDC1Q76NI1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNDC1Q76NI1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms