Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
HECW1Q76N89 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
HECW1Q76N89 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
HECW1Q76N89 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
HECW1Q76N89 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
HECW1Q76N89 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
HECW1Q76N89 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
HECW1Q76N89 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HECW1Q76N89 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HECW1Q76N89 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms