Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2R2Q712K3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms