Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAXIP1Q6ZW49 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms