Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC73Q6ZRK6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms