Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CCDC141Q6ZP82 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC141Q6ZP82 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms