Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNG9

KRBA2, KRAB-A domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA2Q6ZNG9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRBA2Q6ZNG9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRBA2Q6ZNG9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms