Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LBX2Q6XYB7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LBX2Q6XYB7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms