Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBSNQ6UWP8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms