Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO3Q6UWJ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO3Q6UWJ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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