Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASC1Q6TDU7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASC1Q6TDU7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CASC1Q6TDU7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.4 ms