Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A3Q6PIS1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC23A3Q6PIS1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms